Ligase de DNA (ATP ou NAD +) EC #: 6.5.1.6

Nome do Produto DNA ligase (ATP ou NAD +)
Estrutura de exemplo Estrutura de exemplo da DNA ligase (ATP ou NAD +) EC #: 6.5.1.6
Sinônimos Ligase de DNA Tfu
Número EC 6.5.1.6
Número do CAS Registry
Comentários As enzimas das arqueas? Thermococcus fumicolans? E? Thermococcus onnurineus? Mostram alta atividade com ATP ou NAD +, e atividade significativamente mais baixa com TTP, GTP e CTP. A enzima catalisa a ligação das fitas de DNA com os terminais 3'-hidroxil e 5'-fosfato, formando um fosfodiéster e selando certos tipos de quebras de fita simples no DNA duplex. A catálise ocorre por um mecanismo de três etapas, começando com a ativação da enzima por ATP ou NAD +, formando uma ligação fosforamida entre o adenilato e um resíduo de lisina. O grupo adenilato é então transferido para o terminal 5'-fosfato do substrato, formando a estrutura capeada 5 '- (5'-difosfoadenosina) - [DNA]. Finalmente, a enzima catalisa um ataque nucleofílico do terminal 3'-OH no terminal coberto, o que resulta na formação da ligação fosfodiéster e liberação do adenilato. Diferente de EC? 6.5.1.1, DNA ligase (ATP), EC? 6.5.1.2, DNA ligase (NAD +) e EC? 6.5.1.7, DNA ligase (ATP, ADP ou GTP).
Co-fator
História
Reações (1) Atp + (desoxirribonucleotídeo) (n) -3'-hidroxil + 5'-fosfo- (desoxirribonucleotídeo) (m) = (desoxirribonucleotídeo) (n + m) + Amp + difosfato. (2) NAD (+) + (desoxirribonucleotídeo) (n) -3'-hidroxil + 5'-fosfo- (desoxirribonucleotídeo) (m) = (desoxirribonucleotídeo) (n + m) + Amp + beta- nicotinamida D-nucleotídeo.

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