Ligase de DNA (ATP, ADP ou GTP) CE #: 6.5.1.7

Nome do Produto DNA ligase (ATP, ADP ou GTP)
Estrutura de exemplo Estrutura de exemplo da DNA ligase (ATP, ADP ou GTP) CE #: 6.5.1.7
Sinônimos DNA ligase de Hbu, ligase de DNA dependente de cofator múltiplo, ligase de DNA Szi
Número EC 6.5.1.7
Número do CAS Registry
Comentários As enzimas das archaea? Hyperthermus butylicus? E? Sulfophobococcus zilligii? São ativas com ATP, ADP ou GTP. Eles não mostram atividade com NAD +. A enzima catalisa a ligação das fitas de DNA com os terminais 3'-hidroxil e 5'-fosfato, formando um fosfodiéster e selando certos tipos de quebras de fita simples no DNA duplex. A catálise ocorre por um mecanismo de três etapas, começando com a ativação da enzima por ATP, ADP ou GTP, formando uma ligação fosforamida entre adenilato / guanilato e um resíduo de lisina. O nucleotídeo é então transferido para o terminal 5'-fosfato do substrato, formando a estrutura encapsulada 5 '- (5'-difosfoadenosina / guanosina) - [DNA]. Finalmente, a enzima catalisa um ataque nucleofílico do terminal 3'-OH no terminal coberto, o que resulta na formação da ligação fosfodiéster e liberação do nucleotídeo. Diferente de EC? 6.5.1.1, DNA ligase (ATP), e EC? 6.5.1.6, DNA ligase (ATP ou NAD +), que não podem utilizar GTP.
Co-fator
História
Reações (1) Atp + (desoxirribonucleotídeo) (n) -3'-hidroxil + 5'-fosfo- (desoxirribonucleotídeo) (m) = (desoxirribonucleotídeo) (n + m) + Amp + difosfato. (2) Adp + (desoxirribonucleotídeo) (n) -3'-hidroxil + 5'-fosfo- (desoxirribonucleotídeo) (m) = (desoxirribonucleotídeo) (n + m) + Amp + fosfato. (3) Gtp + (desoxirribonucleotídeo) (n) -3'-hidroxil + 5'-fosfo- (desoxirribonucleotídeo) (m) = (desoxirribonucleotídeo) (n + m) + Gmp + difosfato.

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